Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ubl4bQ9CQ84 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ubl4bQ9CQ84 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ubl4bQ9CQ84 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms