Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nudcd2Q9CQ48 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudcd2Q9CQ48 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms