Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NenfQ9CQ45 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NenfQ9CQ45 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms