Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
StambpQ9CQ26 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
StambpQ9CQ26 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms