Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrc18Q9CQ07 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc18Q9CQ07 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc18Q9CQ07 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms