Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdk2ap2Q9CPY4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms