Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bcl11bQ99PV8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11bQ99PV8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms