Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe41Q99PV5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bhlhe41Q99PV5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms