Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rims1Q99NE5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rims1Q99NE5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rims1Q99NE5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms