Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tdrd1Q99MV1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tdrd1Q99MV1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms