Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS7

Ehbp1l1, EH domain-binding protein 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehbp1l1Q99MS7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ehbp1l1Q99MS7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ehbp1l1Q99MS7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ehbp1l1Q99MS7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms