Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epdr1Q99M71 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms