Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gins4Q99LZ3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gins4Q99LZ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms