Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gdpd3Q99LY2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms