Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmtm3Q99LJ5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms