Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cstf3Q99LI7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cstf3Q99LI7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms