Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf34Q99KR6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf34Q99KR6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rnf34Q99KR6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms