Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ciao1Q99KN2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ciao1Q99KN2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms