Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf19Q99KJ5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tcf19Q99KJ5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms