Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps4Q99KG7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps4Q99KG7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms