Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ufsp2Q99K23 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms