Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lims1Q99JW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lims1Q99JW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms