Protein–RNA interactions for Protein: Q99J93

Ifitm2, Interferon-induced transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm2Q99J93 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifitm2Q99J93 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifitm2Q99J93 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms