Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddb2Q99J79 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms