Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apobec3Q99J72 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms