Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atad3Q925I1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atad3Q925I1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atad3Q925I1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms