Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtn4ip1Q924D0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtn4ip1Q924D0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtn4ip1Q924D0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtn4ip1Q924D0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtn4ip1Q924D0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtn4ip1Q924D0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rtn4ip1Q924D0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rtn4ip1Q924D0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rtn4ip1Q924D0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rtn4ip1Q924D0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms