Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim59Q922Y2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim59Q922Y2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms