Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Riok1Q922Q2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riok1Q922Q2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riok1Q922Q2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms