Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarca5Q91ZW3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarca5Q91ZW3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarca5Q91ZW3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms