Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx18Q91ZR2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms