Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Pde6cQ91ZQ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Pde6cQ91ZQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Pde6cQ91ZQ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Pde6cQ91ZQ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Pde6cQ91ZQ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde6cQ91ZQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Pde6cQ91ZQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Pde6cQ91ZQ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pde6cQ91ZQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Pde6cQ91ZQ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pde6cQ91ZQ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pde6cQ91ZQ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Pde6cQ91ZQ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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