Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc5a4bQ91ZP4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms