Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc49Q91YK0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc49Q91YK0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms