Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Basp1Q91XV3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Basp1Q91XV3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms