Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Setd3Q91WC0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd3Q91WC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Setd3Q91WC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms