Protein–RNA interactions for Protein: Q91W67

Ubl7, Ubiquitin-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl7Q91W67 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ubl7Q91W67 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubl7Q91W67 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl7Q91W67 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl7Q91W67 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl7Q91W67 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl7Q91W67 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl7Q91W67 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl7Q91W67 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl7Q91W67 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubl7Q91W67 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms