Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col26a1Q91VF6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col26a1Q91VF6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col26a1Q91VF6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col26a1Q91VF6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms