Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hps3Q91VB4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hps3Q91VB4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms