Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgbl1Q8VDV0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgbl1Q8VDV0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgbl1Q8VDV0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgbl1Q8VDV0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgbl1Q8VDV0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgbl1Q8VDV0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgbl1Q8VDV0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgbl1Q8VDV0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgbl1Q8VDV0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgbl1Q8VDV0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms