Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RhovQ8VDU1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RhovQ8VDU1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms