Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rprd1aQ8VDS4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1aQ8VDS4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 350.1 ms