Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx7Q8VDS3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms