Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ttc8Q8VD72 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc8Q8VD72 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc8Q8VD72 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms