Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ubxn4Q8VCH8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubxn4Q8VCH8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms