Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ApobrQ8VBT6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ApobrQ8VBT6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ApobrQ8VBT6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms