Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup35Q8R4R6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nup35Q8R4R6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms