Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf4Q8R368 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dnaaf4Q8R368 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnaaf4Q8R368 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnaaf4Q8R368 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnaaf4Q8R368 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnaaf4Q8R368 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnaaf4Q8R368 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms