Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Colec12Q8K4Q8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Colec12Q8K4Q8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colec12Q8K4Q8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colec12Q8K4Q8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colec12Q8K4Q8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colec12Q8K4Q8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colec12Q8K4Q8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colec12Q8K4Q8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colec12Q8K4Q8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Colec12Q8K4Q8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms