Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q0

Rptor, Regulatory-associated protein of mTOR, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptorQ8K4Q0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RptorQ8K4Q0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptorQ8K4Q0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptorQ8K4Q0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms